Vattennivåerna i södra Sindh-provinsen och i de nordvästra delarna av landet sjönk under torsdagen. Överallt längs vägar och utanför de stora städerna växer nu tältlägren upp. Förhållandena för de över två miljoner flyktingarna är mycket svåra.
Hudinfektioner, diarrésjukdomar och skabb härjar, sade en läkare till nyhetsbyrån AFP. Enligt honom var barn särskilt utsatta efter att ha druckit eller vadat genom vatten som smittats av kloakvatten.
FN vädjade i onsdags om 460 miljoner dollar i katastrofhjälp till Pakistan. Pengarna behövs till mat, rent vatten, skydd och mediciner, sade John Holmes, FN:s samordnare av katastrofinsatser, vid en givarkonferens i New York. Hittills har löften kommit om 150 miljoner dollar.
Enligt uppgifter som släpptes av de federala myndigheterna i Pakistan i onsdags har 1 270 människor bekräftats döda och över 290 000 hem har förstörts efter de svåra monsunregnen. FN beräknar dödssiffran till runt 1 600.
Enligt nyhetsbyrån Bloomberg har viktig infrastruktur förstörts och oljeproduktionen bromsats upp. Bland annat har en anläggning för bearbetning av råolja i miljonstaden Multan som hanterar en tredjedel av landets produktion tvingats stänga.
Pakistans kritiserade president Asif Ali Zardari begav sig till Sukkur i Sindh, en av de översvämningsdrabbade provinserna i södra Pakistan, på torsdagen. President Zardari har sedan återkomsten i tisdags från sin kritiserade Europaresa suttit i överläggningar i Karachi.
Upp till 14 miljoner människor, eller åtta procent av befolkningen, bedöms ha drabbats direkt eller indirekt av översvämningskatastrofen, landets hittills värsta humanitära kris.